Popisem to co je konkretne na tom screenshote - zakladnou stavebnu castou ludskej DNA je cytozin (jeden zo styroch nukleotidov z ktorych sa sklada DNA). Pre vedcov je extremne dolezite vediet presne vyratat ako cytosin reaguje s inymi molekulami, pretoze len tak sa da zistit ako reaguju rozne proteiny (a teda aj lieky) s nasou DNA a mozu tak napr. opravovat poskodenia DNA (rakovina, atd). Aby mohli autori projektu vylepsit kvantovu montecarlo metodu ktorou to rataju, potrebuju zacat pri jednoduchsich ulohach. Na tom konkretnom screenshote su teda dva cytoziny, pre ktore sa pocita ich vzajomna interakcia - vo forme potencialnej energie (nieco ako elektrostaticke napatie - pritahovanie ci odpudzovanie), a to pre rozne pozicie a vzdialenosti tychto dvoch molekul. Ta vizualizacia je velmi zjednodusena - gulicky su atomy, male poletujuce bodky su elektrony, a palicky su vazby medzi atomami. V skutocnosti je to inak, ovela viac kvantove, to znamena jedna sa skor o oblaciky elektronov a atomovych jadier. Takto zobrazene je to vsak efektnejsie a prehladnejsie.Rampa píše:ovládání je ok, ale ta fyzika, respektive co to vlastně ukazuje, samozřejmě vím o co jde v tomto projektu, ale neumím si to moc přiřadit k tomu screensaveru.
p.s. posílají ještě občas jednotky z alfa fáze
Cielom je teda vypocitat potencialnu energiu medzi dvoma molekulami (ta sa zobrazuje dole ako ta nepravidelna krivka - ked je krivka vysoko, znamena ze v danej pozicii sa tie dve molekuly silno pritahuju, ak je nizko, molekuly sa pritahuju malo alebo sa dokonca odpudzuju) v zavislosti od roznych pozicii a vzdialenosti zucastnenych molekul, vdaka comu dokazu vedci zistit, ci je algoritmus vypoctu dobry a ci metoda funguje. Interakcia dvoch cytozinov je totiz jedna z najlepsie preskumanych a aj experimentalne znamych interakcii biomolekul. Ak tie krivky nebudu sediet so znamymi hodnotami, metodu bude treba vylepsit.
