Stránka 1 z 2

Japonske BOINC projekty

Napsal: ned bře 27, 2005 10:58 am
od Honza
Ano, je to tak...
electe je renderovaci projekt, bolero patri do life science - konkretne pak hledani leku - a dotretie chronos, ktery se hraje s lidskymi chromosomy...

Re: Japonske BOINC projekty

Napsal: ned bře 27, 2005 11:23 am
od reALTom
Honza píše:Ano, je to tak...
electe je renderovaci projekt, bolero patri do life science - konkretne pak hledani leku - a dotretie chronos, ktery se hraje s lidskymi chromosomy...
Asi jsem to vcera vecer zase prehnal, vidim tam divny znaky a dela se mi z toho spatne. Radsi pujdu jeste spat. :lol:

Re: Japonske BOINC projekty

Napsal: ned bře 27, 2005 11:34 am
od Honza
reALTom píše:Asi jsem to vcera vecer zase prehnal, vidim tam divny znaky a dela se mi z toho spatne. Radsi pujdu jeste spat. :lol:
No pravda, je to trochu Japonsky.

Cely projek ma nektere vyhody a nevyhody - tak trebas patri nevyhodou je, ze na to nelze pouzit bezny BOINC, ale je trebas stahnout jejich (ma pouze 1MB).
Bezi to na https (tedy secure), benchmark maji trochu jiny (mozna i lepsi), a na zalozeni uctu neni treba posilat potvrzovaci mail, ale rovnou je po vlozeni jmena, hesla a kontrolnich otazek obejvi AccountId na obrazovce.

Takhle nejak mi vylezl start japonskeho BOINCu; hlasky jsou english, ze menu a zbytek je v cajovem pismu (alespon polozky jsou stejne umisteny a sem tam je nejaka navic...
BOINC - 2005-03-27 12:29:07 - Starting BOINC client version 2.19 (windows_intelx86)
BOINC - 2005-03-27 12:29:07 - No general preferences found - using BOINC defaults
BOINC - 2005-03-27 12:29:07 - Running CPU benchmarks
BOINC - 2005-03-27 12:29:08 - Suspending computation and file transfer - running CPU benchmarks
BOINC - 2005-03-27 12:29:17 - Benchmark results: 152 million floating point ops/sec
BOINC - 2005-03-27 12:29:17 - Benchmark results: 86 million integer ops/sec
BOINC - 2005-03-27 12:29:17 - Benchmark results: 936 million bytes/sec memory bandwidth
BOINC - 2005-03-27 12:29:17 - CPU benchmarks complete
Uz to pocita...teda to jsou veci :roll:

Napsal: ned bře 27, 2005 11:46 am
od 4D 61 72 74 69 6E=Martin
hmm, zajímavé...třeba nám to Duro Kotulic Bunta přeloží do lidštiny... :D

Napsal: pon bře 28, 2005 2:45 am
od Duro Kotulic Bunta
4D 61 72 74 69 6E=Martin píše:hmm, zajímavé...třeba nám to Duro Kotulic Bunta přeloží do lidštiny... :D
:wink:
No ja sa japonsky zatial ucim len styri mesiace a kedze pouzivaju styri abecedy (vratane kanji - cinskych znakov, ktorych pouzivaju oficialne 2000 ale neoficialne asi 6000), tak mi toto este nejaku tu chvilku potrva. :wink:

Ale ak ste sa zhrozili z pohladu na japonske "kliky-haky", existuju automaticke prekladace, ktore sice nie su nejake super, ale da sa pochopit co vyprodukuju. Jednym z jednoduchych je napr. google toolbar - nainstalujete si to a hocikedy pri prezerani webu mozete pravym tlacitkom mysi kliknut na stranku a objavi sa vam polozka "translate into English", a vsetko NEgraficke na stranke vam to prelozi do anglictiny, pohoda.
Alebo existuju aj niektore vcelku fajn online prekladace, kde copy-pastenete japonsky text do laveho okna a prelozi vam to (JP do EN je po japonsky taky obdlznik z jednou prieckou do takeho zlozitejsieho cinskeho znaku, default je na tej stranke nastavene preklad EN do JP, takze to tam staci jednoducho prehodit, je to lahko viditelne...).
Ja tu fungujem bez probemov na tychto veciach, a ide to dobre, dokonca som uz aj cez ten online prekladac kupoval aj digital v obchode kde vobec nevedeli anglicky ale pekne sme sa cez hento dorozumeli. I ked je fakt, ze komercny soft je lepsi, napr. mam slovnik na PDA ktory obsahuje cca milion vyrazov, takze to je lepsie, ale na browsovanie stranok tamtie free prekladace uplne stacia...

Btw, tie projekty vyzeraju velmi pekne, skoda ze nie su pod standarnym Boincom...

Napsal: pon bře 28, 2005 8:23 am
od 4D 61 72 74 69 6E=Martin
no jo, to je vlastně fakt....dyť je to i v Opeře - oznažit text, pravé tl. Translate > Japanese to English ...vůbec mě to nenapadlo...no, uvidime.

Re: Japonske BOINC projekty

Napsal: úte bře 29, 2005 7:37 am
od forest
Honza píše:
reALTom píše:Asi jsem to vcera vecer zase prehnal, vidim tam divny znaky a dela se mi z toho spatne. Radsi pujdu jeste spat. :lol:
No pravda, je to trochu Japonsky.

Cely projek ma nektere vyhody a nevyhody - tak trebas patri nevyhodou je, ze na to nelze pouzit bezny BOINC, ale je trebas stahnout jejich (ma pouze 1MB).
Bezi to na https (tedy secure), benchmark maji trochu jiny (mozna i lepsi), a na zalozeni uctu neni treba posilat potvrzovaci mail, ale rovnou je po vlozeni jmena, hesla a kontrolnich otazek obejvi AccountId na obrazovce.

Takhle nejak mi vylezl start japonskeho BOINCu; hlasky jsou english, ze menu a zbytek je v cajovem pismu (alespon polozky jsou stejne umisteny a sem tam je nejaka navic...
BOINC - 2005-03-27 12:29:07 - Starting BOINC client version 2.19 (windows_intelx86)
BOINC - 2005-03-27 12:29:07 - No general preferences found - using BOINC defaults
BOINC - 2005-03-27 12:29:07 - Running CPU benchmarks
BOINC - 2005-03-27 12:29:08 - Suspending computation and file transfer - running CPU benchmarks
BOINC - 2005-03-27 12:29:17 - Benchmark results: 152 million floating point ops/sec
BOINC - 2005-03-27 12:29:17 - Benchmark results: 86 million integer ops/sec
BOINC - 2005-03-27 12:29:17 - Benchmark results: 936 million bytes/sec memory bandwidth
BOINC - 2005-03-27 12:29:17 - CPU benchmarks complete
Uz to pocita...teda to jsou veci :roll:
¨
Osobně bych do toho nešel, dokud to nepojede pod standartním klientem Boinc. Byl by v tom hroznej hokej :lol:

Napsal: úte říj 18, 2005 7:11 am
od Duro Kotulic Bunta
Japonske Boinc projekty narozdiel od niektorych inych naozaj funguju a vyzera ze sa pekne rozvijaju a ziju. Holt, japonci su proste makaci a ked nieco zacnu tak na tom aj robia, to je ta pozitivna stranka stresoveho japonskeho zivota... Odkaz na ich projekty sa uz objavil aj na homepagei Boincu.

Nepaci sa mi, ze

- stale maju nestandardny boinc soft
- nemaju stranky v anglictine

Paci sa mi, ze (sice v japoncine, ale) maju najpodrobnejsie info o tom, co sa rata, spomedzi vsetkych tych life science projektov, ktore sa vyrojili.

Kedze nepredpokladam, ze vela z vas ma nervy borit sa s kostrbatym prekladom z japonciny, par viet by som zhrnul.

Zaujimave je napr. to, ze projekt BOLERO sa zaobera vztahom genov a imunitnej reakcie organizmu, inymi slovami aj evoluciou genov zodpovednych za produkciu antibakterialnych latok v bunkovej membrane/povrchu (specialna struktura vybudovana z peptidov/cukrov).

Projekt PROSURFER pocita podobnost povrchov proteinov, co je dolezite pri ich funkcnosti - proteiny totiz funguju najma na zaklade elektrostastickych interakcii medzi nimi a bunecnou strukturou, ktore do velkej miery zavisia na povrchovej podobnosti proteinov. Vyvinutim vhodneho softu na porovnavanie povrchov proteinov teda mozme odhalit nove funcie proteinov ktore sme doteraz nepoznali, a teda vyrobit z tychto proteinov ucinne lieky na choroby na ktore sa doteraz vobec z nevedomosti nepozivali. Pre porovnanie (i ked nie z proteinoveho sudka) - podobnost molekularnej povrchovej a geometrickej struktury ma napr. za nasledok psychotropne ucinky LSD, ktora je podobna prirodzenym neurotransmiterom v mozgu, zaujme teda ich miesto a "pokrivi" vase vnimanie reality, ktora je za normalnych podmienok "kodovana" ci "pokrivena" len prostrednictvom serotoninu a dalsich asi dvesto neurotransmiterov prirodzene sa vyskytujucich v nasom mozgu.

Projekt ELECLE viac menej sluzi na to, aby sa biologicke distributed computing veci stali aj graficky a uzivatelsky pritazlive, ide o renderovanie kratkych filmov ci animacii pre verejnost. Tiez uzitocna vec podla mna, na ktoru ine life science projekty (na ich skodu) zabudaju.

Projekt CHRONOS (vidiet ze japonci maju znalosti aj o nasej zapadnej mytologii :-) ) ma za ulohu vypocitat vztah medzi genmi v chromozomoch a ich kombinaciami a roznymi genetickymi chorobami, ako napr. geneticka nachylnost na vznik rakoviny (to suvisi najma s tym, ked vase telo ma vdaka nevhodnej kombinacii genov problem vyrabat iste druhy enzymov), ci cukrovky.
Je to zaujimave z toho dovodu, ze sa sustreduje nie na samotne proteiny (ako napr. predictor) ale priamo na povod celeho problemu - identifikacie genov ktore tieto problemy sposobuju. Okrem toho, ako mozno niektori viete, nedavno sa podarilo kompletne zmapovat cely ludsky genom (to znamena poradie upne vsetkych genov, ktore vytvaraju ludsku DNA molekulu a teda koduju celeho cloveka). To je obrovsky uspech, problem je zatial v tom, ze mame sice kompletne poradie nasich genov (ci presnejsie ich casti - nukleotidov), ale pri vacsine z nich zatial nevieme co koduju a naco su dolezite (nehovoriac o tom, ze vacsina nasho genetickeho kodu nekoduje vobec nic dolezite, je to len evolucny zvysok, ktory vsak je velmi uzitocny pri odolnosti voci novym zmenam prostredia a je pricinou napr. odolnosti bakterii voci antibiotikam). Mame teda obrovsky zoznam zakodovanej informacie o nasom tele, a musime sa z toho vysomarit - cast z toho (tykajucu sa genetickych chorob) sa snazi rozkodovat prave CHRONOS.

A v neposlednom rade realizovali napad vytvorit hru pod nazvom "bunka a koshi", co je myslim velmi dobry napad ako propagovat myslienku life science a konkretne distribuovanych vypoctov a boinc.

Takze uz len treba dufat, ze japonci to prelozia aj do anglictiny, pretoze tazko ludia mimo japonska budu do toho cumiet a zucastnovat sa, ak to je v cinskych klikoch hakoch prespikovanych japonskymi slabicnymi abecedami, a podla kvality projektov by bola velka skoda keby to zostalo uzavrete len pre japonskych ucastnikov.

Napsal: úte říj 18, 2005 8:15 am
od Duro Kotulic Bunta
Len kratka poznamka - aby ste vedeli co to asi "povrch proteinu" znamena, pozrite si tento obrazok. Je to povrch ktory "citi" ina molekula, ktora sa k proteinu blizi alebo s ktorou protein ma interagovat (zavisi od typu tejto molekuly, iny povrch proteinu citi napr. voda a iny alkoholovy roztok). Kedze je to svet malych castic, je to znacne ina vec ako povrch, ktory by si laik ako prvy predstavil - nejedna sa teda o ziadne "gulicky atomov", ale skor nieco co vyzera ako rozliata voda v beztiazovom stave. Suvislost nie je vobec nahodna, povrchove napatie vody a elektrostaticke napatie na povrchu proteinov su si naozaj podobne..

Vypocet tychto elektrostatickych povrchov je dost casovo narocny, aj preto je dobre nan vyuzit Boinc...

Napsal: stř říj 19, 2005 3:48 am
od Duro Kotulic Bunta

Napsal: stř říj 19, 2005 8:43 am
od Honza
Jo, skoda ze nejsou English. Kdyz jsem ty projekty objevil, zamlovalo se mi to. Ale ze to neni En a jeste nestandarni BOINC client... :?

Napsal: stř říj 19, 2005 9:42 am
od PavolR
Duro dakujem Ti za Tvoj fundovany vyklad k japonskym projektom. :) :) :)

Napsal: sob úno 18, 2006 5:57 pm
od Rampa
kdo na cellcomputing založil team CNT ?? :D

Napsal: pon úno 20, 2006 8:47 am
od forest
Já, ale ještě pořádně nebyl čas to dodělat a také dodělat návod který už jsem začal připravovat, aby se v tom rozsypaném čaji vyznali také ostatní.
S tím vytvořením našeho týmového účtu mně pomohl před pár měsíci Duro, ale od té doby se řeší různé jiné věci, takže nebyl nějak čas to dodělat.

Napsal: pon úno 20, 2006 9:16 am
od Rampa
děláš na návodu? super. mě se podařilo vytvořit účet a už i počítám. chtěl jsem sám vytvořit nějaký návod pro zájemce, na základě toho neofic. anglického překladu na který je tu kdesi odkaz, ale tam by to chtělo zaktualizovat některé obrázky protože neodpovídají momentálnímu stavu a taky to není úplně přesné, bez překladače v opeře bych to nedal takže kdych nějak mohl pomoci s přípravou budu rád. jinak je tam založen CNT se spodníma pomlčkama místo mezer protože to jinak nejde že?