Forum boinc.cz

Sem piště aktuální stav projektu, problémy, výpadky. Tato diskuse bude časem promazávána - měsíc starý výpadek tu asi nikoho zajímat nebude, tak proto zvažte debatu na jiným tématem.
dejv

Nová verze aplikace - zpráva ze serveru projektu:

Rosetta@home has been updated to version 5.32 -- our first update after CASP7. The new update has two major new features: 1. protein sidechains are shown in the graphics during Rosetta full-atom simulation stage; 2. a new type of structure prediciton task -- protein-protein docking is running on Rosetta@Home now.

Aby nebyly věci tak jednoduché, s novou aplikací přišel nový problém u jednoho typu jednotek:

11.10.2006 12:56:26|rosetta@home|Checksum or signature error for 1SPB.map
11.10.2006 12:56:27|rosetta@home|Unrecoverable error for result DOC_1SPB_U_pert_bench_1263_419_1 (WU download error: couldn't get input files:<file_xfer_error> <file_name>1SPB.map</file_name> <error_code>-200</error_code></file_xfer_error>)

U mě se objevil stejný problém:

11.10.2006 16:29:13|rosetta@home|Finished download of file 2BTF.map
11.10.2006 16:29:13|rosetta@home|Throughput 441 bytes/sec
11.10.2006 16:29:13|rosetta@home|Checksum or signature error for 2BTF.map
11.10.2006 16:29:14|rosetta@home|Unrecoverable error for result DOC_2BTF_U_pert_bench_1263_963_0 (WU download error: couldn't get input files:<file_xfer_error> <file_name>2BTF.map</file_name> <error_code>-200</error_code></file_xfer_error>)

Rekl bych, ze to byly jen momentalni problemy.

Už je vše v pořádku, tak jedeme dál.

Rosetta ma novejsi aplikaci 5.34 udajne umoznujici pouzit presnejsi funkce
pro vypocet energie a ziskat tak zajimavejsi tvary proteinu.

Ta nova aplikace je nejaka nenazrana, bere mi vic jak 200MB pameti, to neni zrovna malo.

Vcera rano jsem do tabulky doplnil novou verzi vcetne udaje pameti, kolik mi to zralo - taky jsme na to s dejvem docela verjali, protoze to bylo uz asi po 90 vterinach vypoctu.
Je vcelku mozne, ze mnoztvi vyuziti pameti je dynamicke podle jeji dostupnosti, stejne jako v pripade aplikace SETI.

Honza píše:Vcera rano jsem do tabulky doplnil novou verzi vcetne udaje pameti, kolik mi to zralo - taky jsme na to s dejvem docela verjali, protoze to bylo uz asi po 90 vterinach vypoctu.
Je vcelku mozne, ze mnoztvi vyuziti pameti je dynamicke podle jeji dostupnosti, stejne jako v pripade aplikace SETI.

Jo, mne vcera rosetta odmitla poslat dalsi wu, protoze prej nemam dost pameti. Sakra, to je 4 roky stary 256 MB Pentium III uz takovej srot???

Ahoj a vitej na foru
Kdyz se podivas do te Honzovy tabulkytak tam je cislo 265MB RAM. A neco mi rika ze 256 je min.
Ale na PIII muze jet fura jinych projektu Einstein, uFluid, QMC...

Nahodou jsem kouknul na verzi 5.40 a ma docela zajimave zmeny v grafice...urcite to casem prejde do oficialni verzi na Rosette.

Update na 5.40 je uz oficialne oznamen, ale Rosetta je momentalne down.

Rosetta běží, verze 5.40 se soustřeďuje na Alzheimera, respektive obecně na amyloidové nemoci (Alzheimer, Parkinson, diabetes II.typu nebo sporadické CJD - "lidská obdoba šílenejch krav")... Jak na fóru R@H pár lidí píše, je jim teď jasněji co se tam počítá (předpovídá) a soustřeďují 100% výpočtů na R@H...

Rosettka presla na aplikaci 5.43 testovanou na Ralphu.
Byla redukovana komplexnost grafiky a moznost otaceni modelu mysi, aby se zabranilo padum aplikace...ale zase se to tam vrati (az to poresi).