Forum boinc.cz

Rampa píše:ovládání je ok, ale ta fyzika, respektive co to vlastně ukazuje, samozřejmě vím o co jde v tomto projektu, ale neumím si to moc přiřadit k tomu screensaveru.

p.s. posílají ještě občas jednotky z alfa fáze

Popisem to co je konkretne na tom screenshote - zakladnou stavebnu castou ludskej DNA je cytozin (jeden zo styroch nukleotidov z ktorych sa sklada DNA). Pre vedcov je extremne dolezite vediet presne vyratat ako cytosin reaguje s inymi molekulami, pretoze len tak sa da zistit ako reaguju rozne proteiny (a teda aj lieky) s nasou DNA a mozu tak napr. opravovat poskodenia DNA (rakovina, atd). Aby mohli autori projektu vylepsit kvantovu montecarlo metodu ktorou to rataju, potrebuju zacat pri jednoduchsich ulohach. Na tom konkretnom screenshote su teda dva cytoziny, pre ktore sa pocita ich vzajomna interakcia - vo forme potencialnej energie (nieco ako elektrostaticke napatie - pritahovanie ci odpudzovanie), a to pre rozne pozicie a vzdialenosti tychto dvoch molekul. Ta vizualizacia je velmi zjednodusena - gulicky su atomy, male poletujuce bodky su elektrony, a palicky su vazby medzi atomami. V skutocnosti je to inak, ovela viac kvantove, to znamena jedna sa skor o oblaciky elektronov a atomovych jadier. Takto zobrazene je to vsak efektnejsie a prehladnejsie.

Cielom je teda vypocitat potencialnu energiu medzi dvoma molekulami (ta sa zobrazuje dole ako ta nepravidelna krivka - ked je krivka vysoko, znamena ze v danej pozicii sa tie dve molekuly silno pritahuju, ak je nizko, molekuly sa pritahuju malo alebo sa dokonca odpudzuju) v zavislosti od roznych pozicii a vzdialenosti zucastnenych molekul, vdaka comu dokazu vedci zistit, ci je algoritmus vypoctu dobry a ci metoda funguje. Interakcia dvoch cytozinov je totiz jedna z najlepsie preskumanych a aj experimentalne znamych interakcii biomolekul. Ak tie krivky nebudu sediet so znamymi hodnotami, metodu bude treba vylepsit.

Tady bude něco divně...
Po delší době jsem začal zase s QMC, natáhly se Wu s předpokladem 6h33m. Mám na první WU dopočteno přes 9h, ale těch 6h33 tam je pořád. Ještě že v názvu je ...nodelete...
Co ještě můžu očekávat?

Na QMC "straší" jednotkami o délce i 48h, ale tady je seznam WU podle názvu (ccXX, cn, cn...) já mám teď ještě staré WU wc... a ty jedou k 18h na 1.4Cel M.

azor666 píše:Na QMC "straší" jednotkami o délce i 48h.

Dík, taky jsem to posléze našel. Jen jsem byl zaskočenej, že předpoklad byl 6h a já jel už devátou a procenta pořád 0.

Ten progress by mohl byt opraveny v novejsi verzi 5.05

je zajímavé že mi stále chodí WU pro 3 verze aplikace alpha 5.06 beta 5.01 a beta 5.04

Vcera mi prisla beta 5.05 a po 13 hodinach se hezky spocitala; grafika fachci.

Tak konecne - indikace prubehu je ted i v klientovi.

Kdo je do projektu prihlaseny, tady najde svuj certifikat.

Tak jsem se pokusil také zapojit se svým domácím SUSE linuxovým miláčkem, během chvíle mi to vyžralo 1,5 Gb prostoru na disku a skončil s chybou exceeded disc usage. Nakonec jsem ho musel ručně shodit a navíc se ještě odhlásit od projektu, protože v příslušném slotu samozřejmě zůstaly všechny soubory, včetně toho strerr.txt o velikosti 1,3GB. Možná mám něco blbě nastaveného v preferences, ale vážně mne nenapadá co.

Tak brzy se mi dopocte prvni WU. Celkova doba vypoctu je 60 hodin. Je to normalni?

2 LiborA: ja to pocitam taky na Suse, a vpoho

Ktery typ jednotek? Stahly se mi two-bench15.

Velikostech jednotek by mela byt podle MHz CPU, takze treba 1 GHz by melo dostat 200-hodinovou WU.

Amolqc-beta 5.07. Bezi to na Celeronu 2,53 Ghz

Hmm, jeste pred chvilkou jsem dostal 5.06; novejsi anoncovana na tento tyden jeste nema resit veci kolem fixniho kreditu (ta prijde az xza dalsi tyden ci dva)...takze 5.07 asi pouze resi veci kolem novejsich jednotek.

EDIT: Po pul hodine jsem v cca 7-8%, takze nejakych 6-7 hodin si to veme. Treba zitra zkusim "stesti" na vetsi WU nebo novejsi aplikaci.

Délka výpočtu se liší podle typu jednotek. Za poslední měsíc jsem měl časové rozpětí 2h30min - 30h30min na jednotku. (Athlon X2 4200+, 2GB RAM).